A partir del año 2009 el Colegio San Francisco Coll está implementando anualmente Planes de Mejoramiento en el marco de la Ley SEP. Este compromiso con el Ministerio de Educación y la Fundación Santa Rosa de Lima (institución sostenedora del Colegio ) parte el 2008 cuando se firma  ambos el Convenio de Igualdad de Oportunidades y Excelencia Educativa.

La Subvención Escolar Preferencial busca asegurar que todos los niños y jóvenes reciban una educación de calidad en igualdad de condiciones, y en especial aquellos que por su situación socioeconómica tienen la calidad de “alumnos prioritarios”.

Para saber si un alumno es prioritario se informa anualmente al establecimiento en diciembre, el apoderado puede descargar el certificado en www.ayudamineduc.cl y a la vez realizar allí la apelación correspondiente.

El énfasis del mejoramiento debe estar en los aprendizajes, especialmente en las habilidades de Comprensión Lectora y Razonamiento Matemático. Para ello,  todos los alumnos de PK a 4° Medio son evaluados en tres instancias: inicio, intermedio y al término del año escolar con el propósito de monitorear los avances de los alumnos.